More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2527 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  100 
 
 		 214 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  51.93 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.15 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  39.78 
 
 		 249 aa  131  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  41.01 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  42.78 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  39.47 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  42.17 
 
 		 257 aa  121  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  38.71 
 
 		 265 aa  121  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.31 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.62 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.02 
 
 		 265 aa  118  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  54.72 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  42.47 
 
 		 255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 321 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.95 
 
 		 285 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 286 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  36.31 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  49.11 
 
 		 311 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  54.37 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 322 aa  114  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  46.55 
 
 		 261 aa  114  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.91 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 367 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  51.59 
 
 		 127 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  39.67 
 
 		 314 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  36.84 
 
 		 270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  50 
 
 		 293 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 323 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 358 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 381 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  38.41 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  35.23 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50.52 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  42.96 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  35.03 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  33.65 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 370 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 262 aa  111  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 140 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  47.46 
 
 		 297 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 163 aa  111  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50.91 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  47.93 
 
 		 121 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  54.13 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  39.26 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  37.36 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  45.08 
 
 		 124 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  44.7 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  49.09 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  51.46 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  47.93 
 
 		 121 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 391 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  49.56 
 
 		 284 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  52 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 360 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  50 
 
 		 157 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 335 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 360 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  44.8 
 
 		 124 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  54.35 
 
 		 341 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.35 
 
 		 342 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  50 
 
 		 281 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>