More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2030 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  40.61 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  37.26 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  35.62 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  65.98 
 
 		 162 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  62.11 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  35.9 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  36.53 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  37.89 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  37.44 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  37.11 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 140 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  35.75 
 
 		 324 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  35.41 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  57.43 
 
 		 167 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  35.41 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  36.23 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  35.41 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  54.37 
 
 		 150 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.93 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 163 aa  116  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  34.62 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  34.62 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  34.62 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 121 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  46.55 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.27 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.27 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  34.6 
 
 		 281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.43 
 
 		 163 aa  112  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  37.93 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 170 aa  111  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  47.46 
 
 		 121 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  64.71 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 122 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.31 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  36.32 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  60 
 
 		 162 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  35.32 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  41.33 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 212 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  37.5 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  55 
 
 		 121 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.92 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 408 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  33.64 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  58.14 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 124 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  32.76 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  35.38 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  55.79 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  59.77 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  31.38 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  49.54 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  55.06 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 124 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.02 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  44.62 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  60 
 
 		 119 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  49.54 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  46.34 
 
 		 127 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.04 
 
 		 342 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  36.9 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 144 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  31.38 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 157 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 128 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 206 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  58.16 
 
 		 142 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 145 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  35 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>