More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1631 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  99.57 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  96.68 
 
 
211 aa  418  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  70.33 
 
 
202 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  66.04 
 
 
213 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  66.36 
 
 
214 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  65.57 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  64.9 
 
 
203 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  66.19 
 
 
203 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  65.71 
 
 
203 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  55.77 
 
 
199 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  58.02 
 
 
200 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  61.06 
 
 
212 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  65.62 
 
 
198 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  42 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  61.62 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  61.62 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  40.87 
 
 
251 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  42.27 
 
 
250 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
381 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  39.32 
 
 
333 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  41.75 
 
 
250 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  38.58 
 
 
333 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.69 
 
 
342 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.48 
 
 
341 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.73 
 
 
332 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  62.5 
 
 
263 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  39.39 
 
 
342 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  38.89 
 
 
342 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  49.3 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  57.28 
 
 
337 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  37.38 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  55.77 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
408 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  58.59 
 
 
325 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  49.21 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.88 
 
 
367 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
360 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
360 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  58 
 
 
267 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.05 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  53.85 
 
 
297 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  56.6 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  59 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
163 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  61.46 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  39.06 
 
 
297 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  56.25 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  63.92 
 
 
171 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  61 
 
 
124 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  42.05 
 
 
286 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  39.13 
 
 
424 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  61 
 
 
124 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
121 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  39.15 
 
 
277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.91 
 
 
170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
280 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  53.7 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
283 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
281 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
280 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  56.73 
 
 
247 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  51.89 
 
 
423 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  60 
 
 
155 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  45.65 
 
 
249 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.24 
 
 
285 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
265 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
342 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  60 
 
 
124 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
121 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.13 
 
 
124 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.86 
 
 
165 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
265 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  50 
 
 
281 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
335 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
260 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
121 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  53 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  53.57 
 
 
175 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  61.05 
 
 
139 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  51.28 
 
 
157 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54 
 
 
171 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  49.57 
 
 
322 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
323 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
324 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  46.72 
 
 
150 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
324 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>