More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1509 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  100 
 
 
114 aa  230  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  60.18 
 
 
145 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  62.73 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  62.73 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  59.26 
 
 
122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  67.02 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  61.82 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  60.91 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  58.18 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  61.82 
 
 
155 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  61.46 
 
 
324 aa  121  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.27 
 
 
139 aa  120  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
142 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
171 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  46.9 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  50 
 
 
181 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
186 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  61.46 
 
 
285 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  57.84 
 
 
358 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
137 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
137 aa  116  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
163 aa  116  9e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
370 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  62.22 
 
 
324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  57.69 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  67.06 
 
 
213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
249 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  63.54 
 
 
371 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  48.67 
 
 
129 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
275 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
275 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  50.91 
 
 
128 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
266 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
262 aa  114  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  57.73 
 
 
323 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  56.57 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  56.57 
 
 
249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.95 
 
 
239 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  45.87 
 
 
131 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
238 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
260 aa  110  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  45.38 
 
 
171 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  57.61 
 
 
153 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  44.14 
 
 
137 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
259 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
265 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  45.87 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52 
 
 
246 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  53.85 
 
 
240 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.58 
 
 
267 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
381 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.73 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
199 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  50.53 
 
 
267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
278 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51.65 
 
 
263 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
290 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
367 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
342 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  58.51 
 
 
123 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
217 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
283 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
257 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  51 
 
 
254 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
280 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
277 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
280 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
280 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
145 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
127 aa  107  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.95 
 
 
342 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  63.53 
 
 
213 aa  106  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
277 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
277 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
277 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  57.95 
 
 
341 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
339 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
121 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
238 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  50 
 
 
121 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>