More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2481 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  100 
 
 		 162 aa  322  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  72.53 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  43.67 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  48.12 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  65.42 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  65.98 
 
 		 261 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 360 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 360 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  69.57 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.64 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  60.2 
 
 		 323 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  59.62 
 
 		 324 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  39.22 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 124 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  61 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  49.24 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  57.69 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  52.5 
 
 		 139 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 238 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  60 
 
 		 342 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 370 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  49.65 
 
 		 124 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  55.67 
 
 		 239 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  59 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 352 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  48.85 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50.38 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  48.36 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.48 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  58.77 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  48.85 
 
 		 200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 324 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  59.41 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  59.22 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  48.51 
 
 		 267 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  49.5 
 
 		 267 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  56.07 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 318 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 367 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 265 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 251 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 279 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  53.98 
 
 		 322 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 358 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  53.47 
 
 		 254 aa  107  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 415 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 213 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  48.51 
 
 		 269 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 214 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 417 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  50 
 
 		 203 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  50 
 
 		 213 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 367 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 214 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  43.23 
 
 		 249 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 321 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.57 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  60.82 
 
 		 255 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  56.44 
 
 		 234 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 249 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 265 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  58.76 
 
 		 371 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  47.57 
 
 		 264 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 260 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>