More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3267 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  81.74 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  80 
 
 		 250 aa  361  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  49.19 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  42 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  42.19 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  41.5 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  44.02 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  44.62 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  59.18 
 
 		 198 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  43.55 
 
 		 200 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  59.38 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  55 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  55 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  55 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 203 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 203 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.86 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.53 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 260 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  39.25 
 
 		 315 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  48.57 
 
 		 311 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.31 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 381 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  40.41 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  38.92 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 293 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 415 aa  115  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 324 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  55.77 
 
 		 352 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 417 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  52.63 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  37.95 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  52.63 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  50 
 
 		 285 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  36.75 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  39.02 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 474 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 333 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 455 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  39.08 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  37.8 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 471 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  54 
 
 		 391 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 423 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 468 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.73 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.93 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  48.21 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 163 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 394 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  50 
 
 		 394 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  45.87 
 
 		 342 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  50 
 
 		 370 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 398 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  47.12 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.6 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  45.1 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  40.34 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  36.42 
 
 		 424 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  39.08 
 
 		 175 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 335 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  46.73 
 
 		 346 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  34.8 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  49.02 
 
 		 409 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  47 
 
 		 442 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>