More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3465 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  95.36 
 
 		 250 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  80 
 
 		 234 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  42.64 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  42.27 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  41.62 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  44.22 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  41.85 
 
 		 202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  42.27 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 198 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 200 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.25 
 
 		 206 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.23 
 
 		 203 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 323 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.23 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.23 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  42.08 
 
 		 203 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  34.45 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  48.46 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  52.43 
 
 		 381 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.38 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  55.77 
 
 		 352 aa  118  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  37.93 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  54.37 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 324 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 311 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  37.33 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  37.77 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  36.84 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  41.41 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  46.08 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  37.08 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  43.85 
 
 		 314 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 415 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 417 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  32.71 
 
 		 332 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  34.25 
 
 		 333 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53 
 
 		 391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  50 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  34.25 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  49.47 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  49.47 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 474 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  41.91 
 
 		 367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  38.07 
 
 		 398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 455 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  38.69 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 279 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  34.04 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  41.01 
 
 		 213 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.15 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  40.44 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 342 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  32.97 
 
 		 341 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  45.28 
 
 		 468 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 394 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  33.7 
 
 		 333 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  38.1 
 
 		 163 aa  108  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 335 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  50 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  35.35 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  35.26 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  47.57 
 
 		 423 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  49 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  43.12 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  40.83 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 121 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  51.61 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.08 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  40.61 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 322 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 370 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>