More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0121 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  67 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  65.69 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.33 
 
 		 211 aa  221  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  56.16 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  57.21 
 
 		 203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  57.21 
 
 		 203 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  54.5 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  53.73 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  53.23 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  53.23 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  42.19 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  44.22 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.39 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  64.58 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  61.86 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  61.86 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 337 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  63.44 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  42.21 
 
 		 250 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 333 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  60 
 
 		 341 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  56 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  56 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.33 
 
 		 333 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 333 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  57.43 
 
 		 342 aa  124  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.31 
 
 		 342 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  51.75 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40.11 
 
 		 267 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  46.11 
 
 		 421 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  46.63 
 
 		 419 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  54.87 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 121 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  39.39 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.44 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  58 
 
 		 381 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.07 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  36.32 
 
 		 281 aa  121  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  55.66 
 
 		 247 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  41.75 
 
 		 424 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 283 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 121 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  54.55 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 391 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 408 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  48.51 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  50 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 121 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 124 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 94 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  56.44 
 
 		 331 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 286 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 124 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.78 
 
 		 367 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 310 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 262 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  55.45 
 
 		 471 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 270 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 335 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  44.91 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 314 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  65.91 
 
 		 134 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 322 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  53 
 
 		 259 aa  114  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>