More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0214 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  98.52 
 
 
203 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  92.61 
 
 
213 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  92.12 
 
 
203 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  91.63 
 
 
214 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  92.12 
 
 
213 aa  357  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  87.68 
 
 
202 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  67.62 
 
 
230 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
242 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
242 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
230 aa  287  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
211 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
211 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  67.14 
 
 
211 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  66.67 
 
 
211 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  56.72 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  56.16 
 
 
200 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
200 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
198 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  62.63 
 
 
206 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  62.63 
 
 
206 aa  141  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  41.75 
 
 
251 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.7 
 
 
381 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.64 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  43.55 
 
 
234 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  40.53 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  38.95 
 
 
342 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.34 
 
 
342 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  41.53 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  47.24 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  54.37 
 
 
341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.46 
 
 
267 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  41.53 
 
 
250 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  47.75 
 
 
332 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
297 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
360 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
360 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.96 
 
 
337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  46.85 
 
 
333 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.26 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  49.09 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  54.46 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  46.85 
 
 
333 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  49.55 
 
 
325 aa  125  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.79 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51.89 
 
 
278 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  42.48 
 
 
293 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  50.96 
 
 
335 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
408 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  47.55 
 
 
358 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  46.85 
 
 
333 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
163 aa  124  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
270 aa  124  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  51.52 
 
 
297 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  54.13 
 
 
421 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  54.13 
 
 
419 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  52 
 
 
257 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
281 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  46.28 
 
 
265 aa  122  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
264 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  53 
 
 
321 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
286 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
121 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56 
 
 
124 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  52.07 
 
 
247 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  40.78 
 
 
175 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
163 aa  121  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
186 aa  121  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
150 aa  121  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
281 aa  120  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  55 
 
 
124 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  40.23 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  51.35 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  40.49 
 
 
331 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
121 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
139 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  55 
 
 
155 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
171 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  50.43 
 
 
314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55 
 
 
124 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.88 
 
 
282 aa  118  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
424 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  54.63 
 
 
230 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
260 aa  118  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  42.75 
 
 
423 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.04 
 
 
285 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>