More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2820 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  99.53 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  99.01 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  93.87 
 
 		 214 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  92.12 
 
 		 203 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  92.12 
 
 		 203 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  90.15 
 
 		 202 aa  344  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  68.54 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  68.08 
 
 		 242 aa  294  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  68.08 
 
 		 242 aa  294  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  68.08 
 
 		 230 aa  294  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  67.46 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  67.46 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  67.46 
 
 		 211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  66.19 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  55.22 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  54.41 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  61.62 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  61.62 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  65.62 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 250 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  40 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  39.47 
 
 		 342 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  42.62 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  40.21 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  49.18 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.7 
 
 		 381 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  36.73 
 
 		 333 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.34 
 
 		 342 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.34 
 
 		 341 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  47.75 
 
 		 332 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 335 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.46 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  47.75 
 
 		 333 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  37.64 
 
 		 281 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 367 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  51.92 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  49.09 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 360 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 360 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  39.01 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  47.75 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  54.46 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 297 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  48.7 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 163 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  51.52 
 
 		 297 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 270 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  35.91 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  35.91 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  52 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  35.91 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  35.91 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 471 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 286 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.61 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.93 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 423 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 408 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  40.12 
 
 		 285 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 358 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  50 
 
 		 293 aa  117  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 121 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 139 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 335 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50.45 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 342 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53 
 
 		 124 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 171 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 324 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 283 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 171 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.89 
 
 		 331 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  60 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 94 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 323 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 144 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 265 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 121 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>