More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1684 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  100 
 
 		 150 aa  309  7.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  53.7 
 
 		 171 aa  168  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  70 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  67.78 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  66.3 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  42.34 
 
 		 142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  48.18 
 
 		 211 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.81 
 
 		 408 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  47.45 
 
 		 230 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 335 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  64.13 
 
 		 163 aa  122  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 198 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 242 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 242 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 358 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  46.72 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 199 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 370 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.07 
 
 		 140 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.99 
 
 		 342 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 203 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 339 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  58.43 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  59.34 
 
 		 239 aa  120  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  45 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 203 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.88 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.99 
 
 		 341 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 127 aa  119  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 281 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 259 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  52.04 
 
 		 318 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  47.33 
 
 		 202 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 203 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 285 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.73 
 
 		 206 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 213 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 206 aa  117  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 213 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  54.37 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 266 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 311 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 270 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 324 aa  115  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 217 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 262 aa  115  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.08 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 275 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 243 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 423 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  50.49 
 
 		 278 aa  114  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 286 aa  114  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 263 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 335 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 265 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  60 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 259 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  56.52 
 
 		 240 aa  114  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  46.55 
 
 		 257 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.18 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  51 
 
 		 212 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 322 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.68 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 332 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 337 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 246 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  50 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 269 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  56.7 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>