More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0114 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  66.04 
 
 
139 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  64.49 
 
 
199 aa  133  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.77 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  64.95 
 
 
124 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  71.11 
 
 
140 aa  129  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  73.63 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  64.95 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  73.63 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  65.26 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  63.92 
 
 
124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  64.95 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  66.32 
 
 
145 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  65.22 
 
 
367 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  61.76 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
124 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  67.02 
 
 
371 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  56 
 
 
170 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.38 
 
 
171 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  60.78 
 
 
123 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
114 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  45 
 
 
150 aa  120  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
134 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.4 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.22 
 
 
153 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
360 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
360 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  58 
 
 
165 aa  116  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  43.97 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
332 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  50.43 
 
 
342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
127 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.14 
 
 
211 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
358 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
119 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  60.22 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
333 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  55.32 
 
 
239 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  56.44 
 
 
254 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  50 
 
 
342 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
230 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50 
 
 
342 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  58.77 
 
 
162 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.27 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  60.64 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  57.55 
 
 
121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  58.95 
 
 
286 aa  110  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
217 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  45.91 
 
 
255 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  55.79 
 
 
181 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
121 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
279 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  52.69 
 
 
249 aa  110  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
249 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  52.63 
 
 
267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  58.06 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  58.06 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
333 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  70.89 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
335 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  58.42 
 
 
324 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  46.46 
 
 
203 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
339 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  46.46 
 
 
203 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
324 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  52.63 
 
 
263 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
214 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50.53 
 
 
267 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  56.31 
 
 
227 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57 
 
 
200 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
321 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
137 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
137 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
249 aa  107  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.91 
 
 
342 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
381 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
127 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  58.16 
 
 
261 aa  106  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  56.38 
 
 
468 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>