More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2475 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  58.59 
 
 		 371 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  63.83 
 
 		 238 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  61 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  61 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  61.54 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  69.62 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  60.87 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  65.82 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 367 aa  120  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  63.04 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  45.08 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  65.12 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  50.48 
 
 		 324 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 120 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  40.67 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  60.24 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 303 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 114 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  56.47 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  58.43 
 
 		 122 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 262 aa  109  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  51 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  54.46 
 
 		 257 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  40 
 
 		 264 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.93 
 
 		 211 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 242 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 242 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 230 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 213 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 211 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 211 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 227 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  60.98 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  52.81 
 
 		 211 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  50.54 
 
 		 249 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.49 
 
 		 293 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 203 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 213 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  52.43 
 
 		 214 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  55.42 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 203 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  50 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 198 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 214 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 196 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 335 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 249 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  56.04 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>