More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0555 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  84.47 
 
 		 160 aa  254  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  75.64 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  74.17 
 
 		 159 aa  203  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  69.41 
 
 		 169 aa  199  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  64.5 
 
 		 168 aa  187  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  89.25 
 
 		 182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  72.04 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 367 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 371 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  69.51 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47.48 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  58.24 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 324 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 342 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  67.95 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  62.79 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 358 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 360 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 203 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 221 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 203 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 213 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.92 
 
 		 125 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 213 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  65.38 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  64.1 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  57.61 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 198 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 203 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  52.04 
 
 		 227 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  54.44 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  55.29 
 
 		 204 aa  97.1  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 214 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  62.82 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  60.92 
 
 		 121 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  43.61 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 196 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 266 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 121 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 145 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 206 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 121 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53.33 
 
 		 206 aa  94  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 118 aa  94  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 124 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 211 aa  94  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 199 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 242 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 242 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 131 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  56.32 
 
 		 211 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 131 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  58.23 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  47.12 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  50 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 124 aa  90.9  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  38.18 
 
 		 335 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 238 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 139 aa  90.5  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  58.54 
 
 		 144 aa  90.5  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  44 
 
 		 274 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  44 
 
 		 274 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>