More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  100 
 
 
123 aa  241  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  55.37 
 
 
124 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  54.47 
 
 
124 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  56.45 
 
 
124 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  54.92 
 
 
145 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  52.85 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  59.38 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  56.56 
 
 
142 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
140 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  60 
 
 
125 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  58.42 
 
 
199 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  66.3 
 
 
125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
360 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
360 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
358 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.88 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
139 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
157 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  59 
 
 
212 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
200 aa  110  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  49.51 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
370 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
217 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  47.9 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
275 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
200 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
275 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
266 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  48.08 
 
 
203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
285 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  45.22 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
286 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  51.38 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
324 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
367 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  48.08 
 
 
203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  48.08 
 
 
214 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.13 
 
 
239 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.48 
 
 
314 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
144 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
323 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
199 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  47.12 
 
 
203 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
394 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  51.82 
 
 
371 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  47.12 
 
 
213 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  47.12 
 
 
213 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 
211 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  45.1 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
279 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
265 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
324 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  52.53 
 
 
249 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
227 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50 
 
 
342 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
290 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  50 
 
 
332 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50 
 
 
337 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
202 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
121 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
162 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  53.12 
 
 
297 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  50.51 
 
 
339 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  49.14 
 
 
335 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  50.48 
 
 
341 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  50 
 
 
333 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
367 aa  103  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  50 
 
 
333 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  49 
 
 
342 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  48.11 
 
 
206 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
175 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  49.06 
 
 
333 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  48.11 
 
 
206 aa  103  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
259 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  50 
 
 
335 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
196 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  53.54 
 
 
314 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
262 aa  103  8e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
108 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
124 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  47.42 
 
 
246 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>