More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4056 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  68.18 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
238 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  68.97 
 
 
213 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
303 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
238 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
324 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
358 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
262 aa  112  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53 
 
 
165 aa  111  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  60.23 
 
 
199 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
249 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  65.82 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
155 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
170 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
163 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  59.77 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  56.98 
 
 
198 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  54.02 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  56.99 
 
 
211 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  60.67 
 
 
162 aa  106  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  58.14 
 
 
124 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
330 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
283 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  59.77 
 
 
128 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
144 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
212 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
342 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
124 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
124 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
166 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  56.32 
 
 
122 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
145 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60 
 
 
142 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
203 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  58.43 
 
 
123 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
213 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
258 aa  102  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  59.49 
 
 
121 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  61.25 
 
 
121 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
150 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
367 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
203 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
142 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
214 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  49.44 
 
 
239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  64.47 
 
 
94 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  52.81 
 
 
153 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
213 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
144 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  48 
 
 
186 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
202 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.81 
 
 
181 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  59.77 
 
 
125 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  52.53 
 
 
171 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
203 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
206 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.77 
 
 
125 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  54.26 
 
 
261 aa  100  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
227 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.14 
 
 
200 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.04 
 
 
323 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.23 
 
 
121 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.72 
 
 
206 aa  100  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
335 aa  99.4  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  58.14 
 
 
200 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  58.02 
 
 
230 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
249 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  63.16 
 
 
175 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
255 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
199 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  56.96 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
246 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  53.49 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  46.15 
 
 
263 aa  97.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.31 
 
 
167 aa  97.4  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  59.49 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  46.23 
 
 
278 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  60.76 
 
 
124 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  59.49 
 
 
124 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
259 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
367 aa  95.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  48.31 
 
 
270 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>