More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0749 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  100 
 
 
330 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  61.4 
 
 
204 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  39.31 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0313  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
121 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  60.24 
 
 
121 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  48.7 
 
 
335 aa  106  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  59.77 
 
 
342 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  51.82 
 
 
121 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
121 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
108 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
324 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
242 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
230 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
242 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
230 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
211 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
211 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  55.17 
 
 
211 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
371 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
157 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  40.91 
 
 
262 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
211 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
303 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  55.81 
 
 
122 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  49.54 
 
 
115 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  54.55 
 
 
270 aa  100  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
186 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  49.54 
 
 
115 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  49.11 
 
 
155 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
198 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  48.28 
 
 
125 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  49.53 
 
 
115 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
145 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
221 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
199 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
196 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.02 
 
 
202 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
124 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  54.44 
 
 
153 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  53.33 
 
 
122 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.27 
 
 
239 aa  96.7  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  50.51 
 
 
212 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
238 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  55.81 
 
 
122 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  46.53 
 
 
206 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  54.02 
 
 
179 aa  95.9  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
168 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  55.17 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
124 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  41.38 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  44.92 
 
 
163 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
163 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  46.39 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  56.79 
 
 
124 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
169 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  46.53 
 
 
206 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  55.42 
 
 
110 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
217 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
270 aa  94.4  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  50.46 
 
 
118 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  46.28 
 
 
119 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
162 aa  93.2  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  56.98 
 
 
156 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
150 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  47.96 
 
 
114 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  52 
 
 
238 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
142 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  50 
 
 
124 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
165 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
203 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50.51 
 
 
227 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
213 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
213 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  42.5 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
140 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
214 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.86 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  40.94 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  50.57 
 
 
170 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
160 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  43.38 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  52.87 
 
 
200 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  59.74 
 
 
179 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>