More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5674 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  100 
 
 
110 aa  214  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  62.28 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  62.28 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  71.28 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  59.65 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  72.04 
 
 
124 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  59.83 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  71.26 
 
 
124 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  67.82 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  68.09 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  58.12 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  70.73 
 
 
168 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  67.82 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  65.52 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  53.91 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  53.66 
 
 
371 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
138 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
324 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  64.37 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
122 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
367 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  60.92 
 
 
182 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  55.34 
 
 
360 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  55.34 
 
 
360 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  63.22 
 
 
143 aa  103  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.62 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
358 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.26 
 
 
153 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
221 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.58 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
122 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  55.08 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
171 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
335 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  53.4 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  56.63 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  56.63 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  60.92 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
330 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  48.21 
 
 
163 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
196 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  58.14 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  59.3 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  49.4 
 
 
204 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  57.5 
 
 
342 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
155 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  55 
 
 
168 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
262 aa  90.9  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0313  rare lipoprotein A  58.82 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  55.17 
 
 
257 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  54.22 
 
 
117 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
238 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
199 aa  89.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  59.3 
 
 
163 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  58.14 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
195 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
227 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  49.54 
 
 
211 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  55 
 
 
213 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  49.46 
 
 
167 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  61.11 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
230 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60.47 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
242 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
242 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
211 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.62 
 
 
230 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  55.81 
 
 
203 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  55.81 
 
 
203 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
303 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  64.2 
 
 
185 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  49.45 
 
 
239 aa  87.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
140 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  52.22 
 
 
206 aa  87  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  51.61 
 
 
230 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
275 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  59.3 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  48.31 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  59.72 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
213 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
266 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
206 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  58.75 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
275 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
200 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
170 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  57.47 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>