More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0403 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  363  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  61.75 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  62.09 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  84.11 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  60.11 
 
 		 160 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  61.59 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  68.04 
 
 		 138 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 367 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 371 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  56.04 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  64.63 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  52.43 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  54.64 
 
 		 125 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  44 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 119 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 342 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  47.69 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 227 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.67 
 
 		 125 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 203 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  47.69 
 
 		 214 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.69 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  64.1 
 
 		 124 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 116 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 115 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 115 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  50.47 
 
 		 120 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  97.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 204 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  60.26 
 
 		 115 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 127 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  48 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  50.51 
 
 		 143 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 358 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  50 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 120 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 230 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 124 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 242 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 230 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  59.49 
 
 		 124 aa  94.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  42.74 
 
 		 139 aa  94.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  58.54 
 
 		 144 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 124 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  47.96 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 		 242 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 206 aa  94.4  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  46.72 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 124 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 140 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 266 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 120 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 118 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 150 aa  92  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 239 aa  92  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  57.47 
 
 		 121 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 121 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 167 aa  91.3  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 168 aa  91.3  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  43.64 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0749  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 330 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  47.42 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 124 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.45 
 
 		 122 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  53.93 
 
 		 122 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 196 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  44.07 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 137 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 121 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.42 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 137 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 137 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 137 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  56.1 
 
 		 118 aa  89  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>