More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  247  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  98.4 
 
 
125 aa  244  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  67.26 
 
 
145 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  65.25 
 
 
124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  65.42 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  65.25 
 
 
124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  64.41 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  64.41 
 
 
155 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  63.56 
 
 
124 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  72.53 
 
 
140 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  62.73 
 
 
114 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  73.63 
 
 
142 aa  129  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  68.09 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  50.41 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  65.93 
 
 
360 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  65.93 
 
 
360 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  73.12 
 
 
371 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  50 
 
 
137 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  50.4 
 
 
137 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  48.53 
 
 
181 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  48.8 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  59.68 
 
 
162 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
129 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
131 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  66.3 
 
 
324 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  66.3 
 
 
358 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
367 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  51.52 
 
 
142 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.87 
 
 
153 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  66.3 
 
 
123 aa  117  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50 
 
 
127 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  65.62 
 
 
124 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
221 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
163 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
342 aa  118  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.16 
 
 
199 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58.76 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  50 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  50.91 
 
 
137 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  53.78 
 
 
121 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  58.33 
 
 
239 aa  114  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
150 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  59.14 
 
 
211 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
134 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  49.07 
 
 
147 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
196 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  55.36 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  69.51 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  56.38 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
275 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  60.4 
 
 
200 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.06 
 
 
211 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
275 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  50 
 
 
128 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  57 
 
 
285 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  44.17 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
266 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  54.39 
 
 
122 aa  110  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
212 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
171 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  55 
 
 
259 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
265 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  49.54 
 
 
202 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  65.88 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
227 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  55.26 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  55.26 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  60.4 
 
 
200 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
278 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.49 
 
 
270 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
127 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  65.85 
 
 
115 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
279 aa  108  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
370 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  58.59 
 
 
169 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
238 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  46.03 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50 
 
 
214 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  48.62 
 
 
203 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>