More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1351 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  100 
 
 		 162 aa  333  5e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  58.28 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  60.18 
 
 		 221 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  70.33 
 
 		 196 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  69.23 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  45.06 
 
 		 335 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  60 
 
 		 324 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 360 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 266 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 360 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 358 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 342 aa  117  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 279 aa  117  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  43.79 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.04 
 
 		 239 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 370 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 212 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 339 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  64.63 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  51.49 
 
 		 424 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 259 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 200 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  60 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.85 
 
 		 270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 270 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  37.35 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 202 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  55.43 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.52 
 
 		 297 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  43.54 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 199 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 213 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  49.5 
 
 		 421 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  43.17 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 337 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  49.5 
 
 		 419 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  53.76 
 
 		 342 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 121 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 121 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 263 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  39.16 
 
 		 238 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 265 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  53.76 
 
 		 341 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 243 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 371 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  42.54 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  50 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 367 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  52.75 
 
 		 286 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 367 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 323 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 332 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.65 
 
 		 267 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  44.7 
 
 		 303 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 324 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  53.26 
 
 		 333 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53.85 
 
 		 206 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 264 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 333 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 206 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  55.43 
 
 		 123 aa  104  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50.55 
 
 		 267 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.39 
 
 		 342 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 342 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 217 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 321 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  53.85 
 
 		 254 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 253 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 203 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>