More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4680 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  67.01 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  68.18 
 
 		 108 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  63.16 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 360 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 360 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  44.97 
 
 		 163 aa  121  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 303 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  57.84 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  63.04 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.97 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 324 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  42.07 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  50.47 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  42.45 
 
 		 409 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.39 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.74 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  42.51 
 
 		 331 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  42.76 
 
 		 230 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  51.55 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  45.04 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  43.07 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  55.45 
 
 		 367 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  43.17 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 122 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 335 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 391 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  51.11 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  60.47 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 121 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 155 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 358 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.69 
 
 		 230 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 127 aa  104  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  52 
 
 		 286 aa  104  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 114 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  42.76 
 
 		 250 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  43.66 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  47 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  45.38 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 263 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.76 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.62 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.44 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  50 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.31 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 124 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 259 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 260 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  39.74 
 
 		 324 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 124 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 122 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 121 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 140 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 270 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 144 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 283 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  54.13 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 124 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 145 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 284 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  47.71 
 
 		 139 aa  101  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  41.32 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.63 
 
 		 293 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.68 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 381 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 339 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  50 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>