More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0622 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0622  rare lipoprotein A  100 
 
 
175 aa  348  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.717997  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  98.29 
 
 
238 aa  342  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  54.02 
 
 
303 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.03 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
199 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
360 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
360 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  68.13 
 
 
213 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
342 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
324 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
262 aa  117  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
199 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.46 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  60.23 
 
 
358 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.47 
 
 
211 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
212 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  58.89 
 
 
124 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  51.96 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  50 
 
 
322 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
249 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
323 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
198 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
134 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  51.09 
 
 
239 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.53 
 
 
186 aa  110  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.23 
 
 
153 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
251 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.43 
 
 
121 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50 
 
 
165 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
139 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
145 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  68.35 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.95 
 
 
206 aa  108  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
367 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
278 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  62.96 
 
 
122 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  48.33 
 
 
246 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
206 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  63.41 
 
 
230 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  56.84 
 
 
273 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
214 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48 
 
 
150 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
203 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  56.84 
 
 
273 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.96 
 
 
121 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  62.35 
 
 
162 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
203 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  58.59 
 
 
142 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  63.75 
 
 
168 aa  106  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  60.98 
 
 
94 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
203 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
249 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
163 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
213 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
371 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
124 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
227 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
335 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  64.2 
 
 
122 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
155 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  52.48 
 
 
166 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  61.73 
 
 
121 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  43.59 
 
 
171 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
247 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
142 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  57.95 
 
 
181 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
324 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  45.53 
 
 
318 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
114 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
260 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
167 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
171 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
285 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
258 aa  104  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
120 aa  104  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  56.38 
 
 
234 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  56 
 
 
200 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  58 
 
 
200 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  40.46 
 
 
270 aa  103  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  57.95 
 
 
122 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 
243 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
339 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
163 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  60 
 
 
162 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
265 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
124 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>