More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0301 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  66.35 
 
 
239 aa  279  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.96 
 
 
270 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.36 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  50.79 
 
 
264 aa  246  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.36 
 
 
279 aa  238  9e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  46.82 
 
 
270 aa  225  6e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50.95 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50.95 
 
 
275 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50.95 
 
 
275 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  46.15 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.04 
 
 
249 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  43.1 
 
 
243 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  39.51 
 
 
259 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  44.97 
 
 
259 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.02 
 
 
238 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  43.05 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  43.32 
 
 
322 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  40.31 
 
 
255 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
335 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
253 aa  135  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  38.74 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  49.01 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.9 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  49.01 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  39.34 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  62.24 
 
 
360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.96 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
332 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  62.24 
 
 
360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  39.34 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  59.09 
 
 
342 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  59.09 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  59.09 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  49.29 
 
 
333 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.72 
 
 
260 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  53.6 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  53.79 
 
 
342 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  56.64 
 
 
339 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
342 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  43.9 
 
 
246 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  36.51 
 
 
249 aa  128  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
286 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  60.19 
 
 
358 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  42.93 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  57.27 
 
 
333 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.25 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  35.83 
 
 
325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  48.98 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  56.64 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  33.2 
 
 
331 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56.64 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  34.58 
 
 
267 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  57.66 
 
 
160 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  57.66 
 
 
160 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53.78 
 
 
337 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  37.74 
 
 
269 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  43.36 
 
 
283 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
278 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
342 aa  124  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40.11 
 
 
267 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
280 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  51.79 
 
 
282 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  50.79 
 
 
323 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  42.66 
 
 
277 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
265 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
324 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  40.33 
 
 
281 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
260 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.98 
 
 
381 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  48.48 
 
 
391 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  42.66 
 
 
277 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  59.79 
 
 
262 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  50.44 
 
 
277 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  50.44 
 
 
277 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  34.04 
 
 
311 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  43.27 
 
 
394 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.22 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.1 
 
 
264 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  47.14 
 
 
310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
163 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  52.68 
 
 
423 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  54.31 
 
 
419 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  54.31 
 
 
421 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  48.36 
 
 
224 aa  118  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  48.28 
 
 
442 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  49.57 
 
 
367 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  51.75 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  52.14 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  50.4 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  38.61 
 
 
170 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.97 
 
 
333 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
468 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  46.53 
 
 
352 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>