More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0482 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  38.12 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  39.36 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  35.67 
 
 		 339 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.59 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  60.18 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  51.13 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  37.45 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.35 
 
 		 342 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  38.15 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  37.66 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  43.94 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  37.46 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  58.93 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  41.24 
 
 		 419 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  51.56 
 
 		 421 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  42.95 
 
 		 224 aa  143  4e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  37.83 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 364 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  53.91 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.05 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  55.08 
 
 		 408 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  55.12 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  54.24 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  35.54 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  30.03 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  48.44 
 
 		 424 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  38.7 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  32.69 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.89 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  33.88 
 
 		 265 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  34.74 
 
 		 337 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  36.94 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  38.14 
 
 		 335 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  54.78 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  32.79 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  46.55 
 
 		 455 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  43.3 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  47.65 
 
 		 394 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  46.55 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  55.65 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  32.79 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  32.92 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  32.92 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  32.92 
 
 		 280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  48.52 
 
 		 398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  35.05 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  55.65 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  37.45 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  51.08 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  55.86 
 
 		 468 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  36.58 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  27.91 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  32.91 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  45.68 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  33.74 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  31.97 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  31.68 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  37.14 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  53.04 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  35.34 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  32.38 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  52.03 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  31.56 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  31.56 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  46.3 
 
 		 471 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  54.78 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  32.51 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.09 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  54.72 
 
 		 212 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  44.97 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  43.83 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  31.71 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50.79 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  34.17 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  30.92 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.2 
 
 		 211 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  31.82 
 
 		 270 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  33.99 
 
 		 415 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  31.01 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  46.04 
 
 		 417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  44.52 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  31.17 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  46.4 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  46.4 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.52 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  46.4 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  46.4 
 
 		 211 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  46.4 
 
 		 211 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>