More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0789 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  45.56 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  37.7 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  40.72 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.6 
 
 
239 aa  133  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  36.84 
 
 
249 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  40.64 
 
 
259 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  45.45 
 
 
267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  41.83 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  44.08 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  35.16 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  35.16 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  45.99 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  44.06 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  35.17 
 
 
246 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  40.57 
 
 
200 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.89 
 
 
243 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  37.76 
 
 
270 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  42.51 
 
 
200 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  37.21 
 
 
249 aa  122  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  35.47 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
242 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
242 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.78 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  56 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  50 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  50 
 
 
206 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  33.91 
 
 
310 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  58.76 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  44.96 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  55.43 
 
 
270 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
335 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  44.19 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  41.38 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  53 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.88 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  37.14 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  37.21 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  37.63 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.72 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.46 
 
 
203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
203 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  47.46 
 
 
203 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  45.39 
 
 
321 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
213 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  35 
 
 
295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  54 
 
 
212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
322 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  37.1 
 
 
297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  53 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  36.65 
 
 
311 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  50.98 
 
 
322 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  47.22 
 
 
163 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.15 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
214 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50 
 
 
198 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  36.59 
 
 
170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.66 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60 
 
 
121 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  36.17 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  36.49 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  35.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  38.31 
 
 
163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  39.31 
 
 
217 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
168 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  53 
 
 
342 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
360 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
360 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.96 
 
 
323 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  41.18 
 
 
318 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  49.56 
 
 
227 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
284 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
179 aa  108  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  38.78 
 
 
280 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  52 
 
 
341 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  37.63 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  38.78 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  49.53 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  38.78 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  37.41 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
352 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
262 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54 
 
 
171 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  37.01 
 
 
214 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  38.16 
 
 
283 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>