More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0747 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
165 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  119  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  119  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
262 aa  116  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
358 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
324 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
171 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
163 aa  110  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  46.27 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  44.62 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
367 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
371 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  55.43 
 
 
123 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.53 
 
 
186 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
275 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
275 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
335 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  54.84 
 
 
125 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  51 
 
 
341 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.84 
 
 
125 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
171 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  48.48 
 
 
270 aa  105  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
124 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  52.69 
 
 
122 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  44.63 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  49.49 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
140 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  45.92 
 
 
239 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
199 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
124 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.53 
 
 
286 aa  103  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  40.94 
 
 
181 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
124 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  48.04 
 
 
166 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  46.36 
 
 
157 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  47.06 
 
 
339 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
213 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
279 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  46.85 
 
 
240 aa  102  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  49 
 
 
383 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
217 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
114 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  43.64 
 
 
281 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  42.59 
 
 
167 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
124 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  49.47 
 
 
297 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
238 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  54.17 
 
 
153 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
157 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  46.73 
 
 
211 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  44.64 
 
 
202 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
131 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  50 
 
 
155 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
124 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  43.8 
 
 
342 aa  100  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
242 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
242 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.26 
 
 
227 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
142 aa  100  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
198 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
230 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
230 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
211 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
211 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  44.64 
 
 
203 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  44.64 
 
 
214 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  45.79 
 
 
211 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  44.64 
 
 
203 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  50.56 
 
 
150 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
285 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  51 
 
 
212 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
259 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
213 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
203 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
213 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  45.54 
 
 
394 aa  97.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
408 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
322 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  46.94 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  49.46 
 
 
162 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  39.53 
 
 
367 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  44.55 
 
 
283 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  52.27 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  42.61 
 
 
342 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  42.61 
 
 
341 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  47.19 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
322 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
243 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
259 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  45.76 
 
 
200 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>