More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0676 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  100 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  60.24 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  50.85 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  62.65 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  58.62 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 360 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 360 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  64.86 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.54 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  59.3 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  57.47 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  63.01 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 342 aa  100  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  53.49 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  54.76 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 165 aa  98.6  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  56.32 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  61.04 
 
 		 213 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  49.02 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  48.21 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  49.51 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  49.51 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 94 aa  96.7  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  54.76 
 
 		 324 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 371 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 242 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 242 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 200 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  44.34 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.72 
 
 		 211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  44.14 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.87 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  46.36 
 
 		 238 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  50 
 
 		 261 aa  94  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.43 
 
 		 203 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.43 
 
 		 213 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 199 aa  92.8  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.43 
 
 		 213 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  58.44 
 
 		 257 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 358 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.57 
 
 		 211 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  58.23 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  48.04 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 202 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 339 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  51.72 
 
 		 181 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 200 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  55.68 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  52.33 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  54.22 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  58.23 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  50.59 
 
 		 202 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  45.71 
 
 		 243 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.81 
 
 		 239 aa  89.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50 
 
 		 227 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 241 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  47.13 
 
 		 214 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  50 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  54.32 
 
 		 213 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  43.4 
 
 		 238 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  50 
 
 		 249 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50 
 
 		 186 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  47.13 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  42.72 
 
 		 367 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  45.98 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>