More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3870 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  100 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  63.83 
 
 		 153 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 167 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 371 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 119 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  34.64 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  46.82 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  37.89 
 
 		 170 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.09 
 
 		 267 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  32.09 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  32.09 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  59.3 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  45.99 
 
 		 171 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 115 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  45.19 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 115 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  33.52 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 144 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 145 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  41.38 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  54.81 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50.93 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 163 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 115 aa  101  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 322 aa  101  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 121 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 142 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  40.78 
 
 		 200 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 367 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 114 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.47 
 
 		 140 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  58.14 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  51.04 
 
 		 123 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 179 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  45.92 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54.37 
 
 		 121 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 94 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.1 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.27 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  50 
 
 		 335 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  58.54 
 
 		 144 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 121 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  33.49 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  42.02 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  32.32 
 
 		 129 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  56.18 
 
 		 125 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  57.95 
 
 		 116 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  44.06 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  40.56 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.18 
 
 		 125 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 171 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 297 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.36 
 
 		 181 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  45.26 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 342 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 155 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  50 
 
 		 415 aa  95.5  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  45.87 
 
 		 157 aa  95.5  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  50 
 
 		 417 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  44.76 
 
 		 332 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 124 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  32.22 
 
 		 322 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 310 aa  95.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 120 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  47 
 
 		 341 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 144 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 137 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  39.55 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 120 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.82 
 
 		 124 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  44.35 
 
 		 166 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 124 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 118 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  46.36 
 
 		 117 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 342 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>