More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1087 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  94.89 
 
 		 137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  94.89 
 
 		 137 aa  263  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  94.16 
 
 		 137 aa  260  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  93.43 
 
 		 137 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  72.66 
 
 		 131 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  81.08 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  80.18 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  70.83 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  56.92 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  62.89 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  50.42 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  50.42 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  50.42 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.21 
 
 		 125 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  43.8 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 163 aa  119  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 127 aa  117  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.95 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  50 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 263 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 360 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 360 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 179 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 199 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 139 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 175 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 371 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  55.21 
 
 		 267 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  55.06 
 
 		 257 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 281 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.61 
 
 		 239 aa  104  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  50 
 
 		 249 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  52.08 
 
 		 214 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 358 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  46.73 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 324 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  53.12 
 
 		 267 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  49.07 
 
 		 321 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  36.17 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  40.83 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 242 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 242 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 318 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 230 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 230 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 322 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  47.31 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 221 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 259 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 179 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  39.39 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 259 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 281 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 381 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 213 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 408 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 285 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 335 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 323 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 186 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 367 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 238 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 275 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 202 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 246 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 266 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  45.95 
 
 		 239 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 275 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>