More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1191 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  100 
 
 
137 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  94.89 
 
 
137 aa  264  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  95.62 
 
 
137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  95.62 
 
 
137 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  93.43 
 
 
137 aa  240  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  72.8 
 
 
131 aa  188  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  80.18 
 
 
131 aa  186  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  80.18 
 
 
147 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  72.5 
 
 
129 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.69 
 
 
127 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.6 
 
 
181 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.21 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.44 
 
 
155 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.93 
 
 
124 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
163 aa  121  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  41.22 
 
 
145 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  46.9 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
127 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
140 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
167 aa  117  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  50.41 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  57.58 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.96 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
124 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  56.25 
 
 
267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
163 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
371 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  55.21 
 
 
267 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  39.26 
 
 
142 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
199 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.64 
 
 
239 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
249 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
119 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
165 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
121 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
120 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
227 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
171 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  35.81 
 
 
162 aa  103  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  49.49 
 
 
358 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  42.5 
 
 
128 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  49.46 
 
 
196 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  47.31 
 
 
179 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
175 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
324 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
243 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  42.64 
 
 
214 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.4 
 
 
163 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  45.13 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
170 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
318 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  53.93 
 
 
257 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
322 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  48.42 
 
 
281 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
242 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
242 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50 
 
 
270 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
275 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
230 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
171 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
275 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
266 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
230 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  47.31 
 
 
153 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
259 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
285 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  48.39 
 
 
221 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
269 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.28 
 
 
281 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  44.95 
 
 
259 aa  99.4  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
133 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
381 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.39 
 
 
246 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  46.92 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
408 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  49.46 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  49.48 
 
 
342 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.95 
 
 
342 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  44.57 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50 
 
 
238 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
213 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
321 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
367 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
324 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
202 aa  97.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>