More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0201 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  100 
 
 
133 aa  271  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  72.92 
 
 
163 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  54.89 
 
 
144 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50.85 
 
 
127 aa  117  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.51 
 
 
181 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
129 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  43.61 
 
 
139 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
163 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
150 aa  103  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
170 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
140 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
131 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
127 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  46.55 
 
 
163 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
131 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
167 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  48.62 
 
 
127 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  47.79 
 
 
137 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  48.65 
 
 
163 aa  100  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  50.52 
 
 
147 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  48.21 
 
 
261 aa  100  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  42.4 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
360 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
360 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
137 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
120 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
199 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  49.04 
 
 
198 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  48 
 
 
175 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  41.23 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  41.03 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
358 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  48.98 
 
 
324 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  58.44 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  45.83 
 
 
211 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
124 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  54.65 
 
 
186 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  41.22 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  41.8 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50.68 
 
 
242 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  45.26 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50.68 
 
 
242 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
124 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  48.86 
 
 
124 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  43.27 
 
 
211 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50.68 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  43.27 
 
 
211 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  43.27 
 
 
211 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.68 
 
 
230 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  48.91 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  46.24 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  44.12 
 
 
239 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  46.81 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  40.16 
 
 
122 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  48.91 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  52.05 
 
 
202 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  47.92 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
335 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  45.92 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  38.81 
 
 
203 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  50.68 
 
 
213 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  38.81 
 
 
203 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  45.36 
 
 
259 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
275 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
275 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
266 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  50 
 
 
257 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  50.68 
 
 
203 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  50.68 
 
 
213 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  40.15 
 
 
135 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  37.78 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
371 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
179 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50.68 
 
 
214 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
145 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
200 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  50 
 
 
339 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  42.71 
 
 
200 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  36.22 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  51.14 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0699  rare lipoprotein A  44.09 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  48.94 
 
 
408 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
342 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  47.87 
 
 
217 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
213 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>