More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3199 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  100 
 
 
137 aa  279  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  98.54 
 
 
137 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  97.81 
 
 
137 aa  273  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  95.62 
 
 
137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  94.89 
 
 
137 aa  244  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  71.09 
 
 
131 aa  191  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  80.18 
 
 
131 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  80.18 
 
 
147 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  70.83 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  60.32 
 
 
127 aa  146  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  62.89 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.8 
 
 
181 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  51.33 
 
 
125 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  49.58 
 
 
124 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.93 
 
 
124 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
155 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  46.02 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  48.8 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.96 
 
 
122 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  56.57 
 
 
263 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
150 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
360 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  56.25 
 
 
267 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
360 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  40.74 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
199 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
119 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
163 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
139 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
196 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
179 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  49.48 
 
 
175 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
371 aa  103  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.17 
 
 
267 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
121 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  55.06 
 
 
257 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
120 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50 
 
 
165 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  50 
 
 
249 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
318 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
171 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.58 
 
 
239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  48.42 
 
 
281 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
227 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
324 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
170 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  49.49 
 
 
358 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
163 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
214 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  43.27 
 
 
162 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50 
 
 
243 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  41.67 
 
 
128 aa  100  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  48.42 
 
 
408 aa  100  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  45.79 
 
 
121 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
179 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
120 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
171 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
133 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.08 
 
 
342 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
259 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50 
 
 
270 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  44.95 
 
 
259 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
230 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
242 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
238 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
230 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
242 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
285 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  51.04 
 
 
341 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
275 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.28 
 
 
281 aa  97.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  52.69 
 
 
211 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  46.88 
 
 
322 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
275 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
266 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
278 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  46.24 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.39 
 
 
246 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.92 
 
 
323 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  43.62 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
381 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
221 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  50 
 
 
269 aa  96.7  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
166 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  49.47 
 
 
342 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  42.55 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>