More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0087 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  75.46 
 
 		 213 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  46.28 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  59.79 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  45.38 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  56.18 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 127 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 342 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  37.75 
 
 		 167 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  51.04 
 
 		 153 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  47.41 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 163 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 144 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  41.96 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  46.03 
 
 		 371 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 119 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 163 aa  98.6  9e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  38.36 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  38.36 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 335 aa  97.1  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  42.76 
 
 		 170 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 120 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  38.36 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 118 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  54.88 
 
 		 124 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50 
 
 		 199 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  48.98 
 
 		 120 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  54.88 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  54.65 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 367 aa  95.9  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  46.85 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  49.14 
 
 		 134 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  41.03 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  57.65 
 
 		 114 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  49.41 
 
 		 118 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  49.41 
 
 		 118 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  45.28 
 
 		 137 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 129 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  43.9 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  58.57 
 
 		 116 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  44.63 
 
 		 165 aa  92.8  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  50 
 
 		 118 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 142 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 137 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  44.27 
 
 		 171 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 200 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  60.61 
 
 		 115 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  60.61 
 
 		 115 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 140 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  58.33 
 
 		 261 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 131 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  45.28 
 
 		 137 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  49.06 
 
 		 139 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 157 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  55.7 
 
 		 121 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  52 
 
 		 124 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  59.09 
 
 		 115 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 131 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 124 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 117 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  48.21 
 
 		 358 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  35.71 
 
 		 162 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  39.87 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  39.71 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  45.28 
 
 		 137 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 147 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 122 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 137 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55.06 
 
 		 125 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  55.06 
 
 		 125 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 124 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50 
 
 		 171 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  55.13 
 
 		 94 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  45.79 
 
 		 163 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  40 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 133 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  49.43 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  40.38 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  37.59 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 124 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  49.44 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 175 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 127 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.69 
 
 		 155 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  57.75 
 
 		 122 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  49.44 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  58.57 
 
 		 121 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  57.97 
 
 		 121 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  49.44 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>