More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1446 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  100 
 
 		 144 aa  296  7e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  54.89 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  60.4 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 167 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  42.66 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  40.67 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  38.19 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  49.48 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 408 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  47.37 
 
 		 181 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  39.01 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 198 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  47.87 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 239 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  54.79 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  54.29 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  39.86 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  60 
 
 		 358 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  50 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  39.13 
 
 		 339 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  50 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 360 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 360 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  44.33 
 
 		 312 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  44.23 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  45.98 
 
 		 261 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 314 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  45.54 
 
 		 175 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  42.71 
 
 		 283 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 315 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  40.35 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  40.98 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 312 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  55.07 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  50 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  50 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 371 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  40.5 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 424 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  42.71 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  42.27 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  49.32 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  51.47 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  46.88 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 279 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  45.56 
 
 		 266 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 342 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  42.27 
 
 		 259 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  45.56 
 
 		 221 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  35.25 
 
 		 249 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  44.33 
 
 		 324 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  58.21 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 206 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  42.27 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  47.95 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  50 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  32.88 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>