More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2902 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  62.89 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  65.98 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  61.05 
 
 		 114 aa  110  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  67.39 
 
 		 125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 358 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  62.22 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  58.49 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 124 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  66.25 
 
 		 371 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  47.24 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  42.45 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  65.17 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  50.88 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  53.27 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 242 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 242 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  56.67 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 360 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 360 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  47.5 
 
 		 239 aa  101  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 342 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 199 aa  100  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 238 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 211 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 200 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 249 aa  98.6  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  46.38 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51 
 
 		 279 aa  98.2  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  54.55 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 367 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 275 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 275 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  56.98 
 
 		 238 aa  97.1  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 266 aa  97.1  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.65 
 
 		 267 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  50 
 
 		 203 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 324 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.65 
 
 		 267 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  55 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 293 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 221 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 262 aa  95.9  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 213 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  50 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 213 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 217 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  47 
 
 		 265 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  44.35 
 
 		 335 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  44.66 
 
 		 265 aa  95.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 263 aa  94.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.26 
 
 		 181 aa  94.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 127 aa  94.4  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 116 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  58.82 
 
 		 120 aa  94.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 285 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 280 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 324 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 322 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 283 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 121 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>