More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0455 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  78.67 
 
 		 150 aa  244  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  58.04 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  50.65 
 
 		 154 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  43.84 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  41.73 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  44.36 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  54.84 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  50.56 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  43.22 
 
 		 170 aa  97.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  51.61 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 360 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 360 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 251 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  38.21 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 213 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  46.94 
 
 		 262 aa  93.6  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 247 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  45.74 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  51.14 
 
 		 234 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  42.76 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.14 
 
 		 165 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 370 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 367 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 367 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  50 
 
 		 358 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 221 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0515  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 204 aa  90.5  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 250 aa  90.9  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 323 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 217 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 250 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 324 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 238 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 286 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 249 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  45.19 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 321 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 249 aa  88.2  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  48.42 
 
 		 254 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 198 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  46.07 
 
 		 167 aa  87.8  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  43.82 
 
 		 339 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 238 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  38.41 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 124 aa  87.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 282 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  44.04 
 
 		 199 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  47.19 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 311 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 246 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 206 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  49 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  46.53 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.16 
 
 		 275 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.16 
 
 		 275 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  43.01 
 
 		 297 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.16 
 
 		 266 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 199 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  46.07 
 
 		 322 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 335 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  46.07 
 
 		 265 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 285 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 278 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 333 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  41.49 
 
 		 342 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.49 
 
 		 342 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  43.24 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  44.76 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  35.97 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>