More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3379 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  78.67 
 
 		 150 aa  241  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  56.03 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  51.01 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  50 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  59.79 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  41.13 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  42.65 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47.57 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  47.19 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  42.97 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  51.09 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  45.61 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 367 aa  90.5  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 128 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.14 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 360 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 360 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  39.2 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  45.95 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 166 aa  87.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  47.83 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.71 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  40.98 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  40.44 
 
 		 181 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 238 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 367 aa  84.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 370 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 249 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  43.1 
 
 		 324 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 213 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  43.88 
 
 		 251 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  43.27 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  43.62 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  43.62 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  44.94 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  38.71 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0515  rare lipoprotein A  45.26 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.25 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  44.79 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 217 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 249 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  43.01 
 
 		 297 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1256  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  46.15 
 
 		 211 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 275 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 238 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 275 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 333 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  42.28 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 371 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  35.29 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  40.59 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  46.25 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  46.25 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 323 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  46.25 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 293 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  45.65 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  41.94 
 
 		 342 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 342 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>