More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0489 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  59.79 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  52.46 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  54.64 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  47.12 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  43.62 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 124 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  38.02 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  42.99 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  39.19 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  47.73 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  46.07 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  45.74 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  38.81 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 370 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0515  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  51.81 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  36.73 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  31.41 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  44.68 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  45.35 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 367 aa  77.4  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  45.12 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  43.82 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  41.51 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  44.32 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  41.05 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  44.32 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  44.79 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  42.71 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  41.05 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 310 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  39.78 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  43.18 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  38.1 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 255 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  40.23 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  40.45 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  42.53 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  42.71 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  45.26 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  47.5 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  47.44 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  41.76 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  42.55 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  44.32 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  38.3 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  46.07 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  45.35 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  47.44 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 285 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 323 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  43.68 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  41.86 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  46.43 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  41.49 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  45.12 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6400  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>