More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6400 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6400  rare lipoprotein A  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  63.83 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  50.89 
 
 		 358 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 367 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  52.63 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  47.32 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  51.85 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  41.46 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  47.32 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  51 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  47.27 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  51.69 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  46.36 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  47.17 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  53.26 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  40 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  56.47 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  40.94 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  42.98 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 367 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  49.41 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  47.87 
 
 		 370 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  50 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  50 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  52.5 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  53.01 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  48.91 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  50 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  49.41 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  45.1 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  51.19 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  51.19 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  45.36 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  42.57 
 
 		 341 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  49.4 
 
 		 370 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  55.88 
 
 		 360 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  55.88 
 
 		 360 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  55.88 
 
 		 360 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  42.57 
 
 		 342 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  44.09 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  45.98 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  40.94 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  53.66 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  44.12 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  44.05 
 
 		 335 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  51.19 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  50.63 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  45.71 
 
 		 391 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  40.19 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 199 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  47.62 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  52 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  48.19 
 
 		 375 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>