More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1025 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1025  rare lipoprotein A  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.98 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  45.67 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  46.48 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  50.47 
 
 		 394 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 310 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  54.65 
 
 		 127 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 121 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  52.27 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  46.49 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  43.9 
 
 		 179 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 134 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 140 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  47.32 
 
 		 339 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 121 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  47.75 
 
 		 259 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  54.65 
 
 		 160 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  54.65 
 
 		 160 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.98 
 
 		 367 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  45.71 
 
 		 246 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  46.9 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 171 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 358 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.02 
 
 		 125 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 367 aa  97.8  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 409 aa  97.8  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.81 
 
 		 342 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  42.99 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  44.14 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  50 
 
 		 238 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.81 
 
 		 341 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 455 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 474 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  48.84 
 
 		 335 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  50.54 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 121 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 337 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  51.14 
 
 		 135 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  54.02 
 
 		 125 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  38.28 
 
 		 137 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 342 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 468 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  45.11 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  50 
 
 		 137 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.33 
 
 		 342 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  50 
 
 		 137 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  50 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 442 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  39.06 
 
 		 137 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  49.46 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  48.94 
 
 		 331 aa  95.5  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 124 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  38.33 
 
 		 381 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  52.87 
 
 		 145 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  40.15 
 
 		 166 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 124 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 144 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.81 
 
 		 142 aa  95.1  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 335 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 145 aa  94.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 129 aa  94.7  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  51.72 
 
 		 122 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 286 aa  94.7  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  50 
 
 		 137 aa  94.4  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 263 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  42.98 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  54.12 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 155 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 124 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 122 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 124 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  46.73 
 
 		 273 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  45.1 
 
 		 303 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  57.33 
 
 		 116 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  38.52 
 
 		 163 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 332 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  44.86 
 
 		 342 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  52.33 
 
 		 333 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  42.25 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.16 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>