More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0601 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  92.36 
 
 		 157 aa  291  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0688  rare lipoprotein A  62.76 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000610426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  50.65 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  51.01 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0489  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0379  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0364782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  49.49 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  40 
 
 		 367 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  50.94 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 358 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 124 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 124 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 360 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 360 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 324 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  48.25 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 213 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0689  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  40.8 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4056  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.926393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51 
 
 		 278 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.82 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55.43 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 238 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 371 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 257 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  48.48 
 
 		 342 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 221 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 238 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  47.47 
 
 		 341 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 251 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 199 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 170 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  48.86 
 
 		 297 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  40.77 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  40.65 
 
 		 335 aa  89.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  43.18 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.14 
 
 		 249 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50 
 
 		 260 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 265 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  53.41 
 
 		 323 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 211 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 211 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  40.5 
 
 		 203 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.91 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 230 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 211 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  46.46 
 
 		 211 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 242 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 332 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  37.31 
 
 		 242 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  41.73 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 409 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  40.5 
 
 		 203 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  46.46 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  48.35 
 
 		 246 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  49.44 
 
 		 262 aa  87.8  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  48 
 
 		 297 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  46.79 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50 
 
 		 270 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  50 
 
 		 247 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.42 
 
 		 367 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 249 aa  87.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  41.23 
 
 		 234 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  46.94 
 
 		 325 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 335 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 322 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  44.44 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  46.39 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 206 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  35.82 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0601  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 238 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  50 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 342 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 243 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 265 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  44.19 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 324 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 283 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  48.35 
 
 		 206 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>