41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1493 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
381 aa  741    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.02 
 
 
384 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  49.06 
 
 
374 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  52.27 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  48.4 
 
 
522 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  49.27 
 
 
500 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  45.19 
 
 
499 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  45.21 
 
 
500 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  45.61 
 
 
503 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  46.78 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  49.42 
 
 
501 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  48.53 
 
 
368 aa  268  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.99 
 
 
378 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  43.09 
 
 
399 aa  255  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.04 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.06 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.16 
 
 
457 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  43.8 
 
 
488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  42.08 
 
 
522 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  41.72 
 
 
496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.95 
 
 
380 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.77 
 
 
368 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  35.9 
 
 
349 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  38.18 
 
 
344 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.11 
 
 
387 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  38.75 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.75 
 
 
220 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  42.78 
 
 
366 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.58 
 
 
392 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  22.58 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.22 
 
 
800 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 
222 aa  56.2  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2208  hypothetical protein  24.12 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000512489  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  29.63 
 
 
823 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1333  hypothetical protein  28.8 
 
 
293 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  33.66 
 
 
217 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  26.73 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3056  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.05 
 
 
696 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  27.36 
 
 
261 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  26.26 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3172  hypothetical protein  31.78 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.532877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>