23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1075 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1075  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  872    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000439161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4484  S1E family peptidase  55.93 
 
 
136 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0979006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4483  hypothetical protein  36.98 
 
 
227 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  26.07 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  26.55 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  25 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  25.72 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  24.72 
 
 
522 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.58 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  24.64 
 
 
522 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  22.5 
 
 
500 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  24.28 
 
 
500 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  22.76 
 
 
507 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.8 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.46 
 
 
372 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  24.59 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  26.33 
 
 
496 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  25.81 
 
 
501 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  22.73 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  25.58 
 
 
488 aa  50.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2627  hypothetical protein  25.68 
 
 
482 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.91 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  27.65 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>