44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  100 
 
 		 366 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3177  peptidase  48.15 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  45.93 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.19 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  46.15 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  34.86 
 
 		 381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.28 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  35.22 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  35.1 
 
 		 501 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.73 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.99 
 
 		 496 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  32.72 
 
 		 522 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  32.63 
 
 		 500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.83 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  46.51 
 
 		 522 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  32.85 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  33.91 
 
 		 499 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  40.43 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  32.86 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  34.81 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  31.5 
 
 		 507 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.59 
 
 		 494 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  30.23 
 
 		 503 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 		 457 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.66 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  30 
 
 		 392 aa  92.8  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.71 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0366  hypothetical protein  30.54 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  26.7 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6300  hypothetical protein  25.51 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0821  hypothetical protein  29.44 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  30.63 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2627  hypothetical protein  29.41 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3172  hypothetical protein  26.97 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.532877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0904  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0900  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.38111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5591  hypothetical protein  29.44 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1646  serine protease, DO/DeqQ family  27.69 
 
 		 494 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  37.5 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1346  protease Do  27.69 
 
 		 494 aa  43.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.62004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>