23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2075 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1030    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6300  hypothetical protein  25.13 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  26.85 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2479  hypothetical protein  26.24 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  27.73 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.73 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  24.31 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  29.13 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  25 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  33.17 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  27.32 
 
 		 366 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.15 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  30.24 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  23.29 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  24.44 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  22.83 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.99 
 
 		 220 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  28.06 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  24.19 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.73 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  21.46 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  23.82 
 
 		 501 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  23.85 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>