16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0511 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0511  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  897    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2479  hypothetical protein  28.83 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6300  hypothetical protein  27.09 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2075  hypothetical protein  27.48 
 
 
494 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.277625  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.51 
 
 
372 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  29.91 
 
 
501 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  26.61 
 
 
522 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  28.1 
 
 
496 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3261  hypothetical protein  27.66 
 
 
823 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3868  hypothetical protein  28.74 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2547  hypothetical protein  30.27 
 
 
372 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3440  hypothetical protein  30.65 
 
 
235 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  28.65 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  28.57 
 
 
507 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0531  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  26.89 
 
 
399 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>