10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5576 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1064    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  35.27 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  30.74 
 
 		 614 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  27.92 
 
 		 633 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  26.49 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.84 
 
 		 845 aa  84  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  24.42 
 
 		 727 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  25.16 
 
 		 670 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  25.48 
 
 		 609 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  26.09 
 
 		 830 aa  47  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>