10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3402 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1097    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  35.5 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  34.69 
 
 		 633 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  30.11 
 
 		 614 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  28.57 
 
 		 667 aa  101  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.15 
 
 		 845 aa  97.8  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  31.47 
 
 		 727 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 		 670 aa  86.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  25.2 
 
 		 609 aa  72  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  33.55 
 
 		 830 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>