197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3938 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  100 
 
 
529 aa  1020    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3610  FHA domain-containing protein  70.52 
 
 
1083 aa  246  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133467  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
863 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6874  FHA domain containing protein  32.68 
 
 
512 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  42.57 
 
 
946 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  48.61 
 
 
1011 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.86 
 
 
1004 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  43.66 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  30.53 
 
 
694 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
1065 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  33.7 
 
 
242 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.9 
 
 
238 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
242 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  42.31 
 
 
267 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  40.86 
 
 
155 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  44.05 
 
 
513 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
241 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  33.7 
 
 
252 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0829  FHA domain containing protein  30.88 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00203514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  28.48 
 
 
178 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2501  FHA domain-containing protein  37.84 
 
 
306 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320482  decreased coverage  0.000381992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.3 
 
 
863 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3859  FHA domain-containing protein  34.83 
 
 
195 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  37.18 
 
 
566 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.56 
 
 
510 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
280 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 
503 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.63 
 
 
2449 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  36.17 
 
 
894 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  38.36 
 
 
428 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
268 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0060  FHA domain-containing protein  32.67 
 
 
175 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.399884  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
262 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  35.42 
 
 
503 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.35 
 
 
899 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 
279 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.67 
 
 
851 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  33.94 
 
 
617 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  32.53 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  24.86 
 
 
224 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  36.49 
 
 
137 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0026  FHA domain containing protein  33.7 
 
 
154 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.259874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0034  FHA domain containing protein  42.47 
 
 
175 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3468  FHA domain containing protein  34.34 
 
 
544 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.371082  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  40.28 
 
 
154 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  32.47 
 
 
245 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.33 
 
 
606 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  34.52 
 
 
374 aa  58.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
150 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  35.44 
 
 
253 aa  57.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  43.1 
 
 
618 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  34.31 
 
 
270 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  39.44 
 
 
162 aa  57.4  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  34.41 
 
 
166 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
181 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  32.93 
 
 
350 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
246 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0026  FHA domain-containing protein  35.8 
 
 
248 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  37.23 
 
 
1428 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  34.94 
 
 
388 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  38.46 
 
 
1108 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.48 
 
 
513 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0057  FHA domain-containing protein  35.96 
 
 
150 aa  56.6  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  34.83 
 
 
158 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0029  FHA domain-containing protein  26.32 
 
 
470 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6476  FHA domain-containing protein  35.45 
 
 
158 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0179831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.03 
 
 
777 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  27.96 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0055  Forkhead-associated protein  30.48 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  30.6 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  25.71 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  41.1 
 
 
541 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3741  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
245 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.142285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  28.72 
 
 
673 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1103  FHA domain-containing protein  29.86 
 
 
152 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  30.66 
 
 
485 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0082  FHA domain containing protein  34.07 
 
 
156 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  35.8 
 
 
122 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 
152 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0026  FHA domain-containing protein  31.47 
 
 
149 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  38.57 
 
 
149 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1670  protein kinase  37.14 
 
 
1073 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.375386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  32.22 
 
 
156 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  36.25 
 
 
178 aa  54.7  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  31.91 
 
 
894 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  35.8 
 
 
122 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  41.54 
 
 
848 aa  54.3  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00410  FHA domain-containing protein  31.87 
 
 
156 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  36.99 
 
 
179 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  37.25 
 
 
1034 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
903 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
179 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  36.76 
 
 
153 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  35.14 
 
 
157 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 
165 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0027  FHA domain containing protein  38.81 
 
 
420 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.93 
 
 
1424 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  35.8 
 
 
1057 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  35.8 
 
 
1053 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  27.56 
 
 
269 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>